Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms