Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms