Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms