Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNA6P17658 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA6P17658 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA6P17658 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA6P17658 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA6P17658 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA6P17658 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA6P17658 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms