Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms