Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-EP13747 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms