Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms