Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HKR1P10072 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms