Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI3P10071 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI3P10071 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms