Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms