Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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