Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA3O96018 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA3O96018 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA3O96018 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA3O96018 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA3O96018 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA3O96018 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA3O96018 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APBA3O96018 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APBA3O96018 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APBA3O96018 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APBA3O96018 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APBA3O96018 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APBA3O96018 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APBA3O96018 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA3O96018 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA3O96018 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms