Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POP4O95707 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POP4O95707 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POP4O95707 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POP4O95707 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POP4O95707 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POP4O95707 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POP4O95707 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POP4O95707 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POP4O95707 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POP4O95707 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms