Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL3O95236 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOL3O95236 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOL3O95236 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms