Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF6O75683 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF6O75683 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF6O75683 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF6O75683 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF6O75683 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF6O75683 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF6O75683 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF6O75683 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF6O75683 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms