Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F6O75461 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms