Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms