Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD3O43242 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms