Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPATO15228 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPATO15228 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPATO15228 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPATO15228 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPATO15228 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms