Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms