Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIP1O00291 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIP1O00291 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIP1O00291 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIP1O00291 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIP1O00291 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIP1O00291 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms