Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms