Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN34H7C241 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms