Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms