Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms