Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms