Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms