Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms