Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms