Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms