Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms