Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms