Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms