Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD54L2Q9Y4B4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD54L2Q9Y4B4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms