Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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