Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms