Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms