Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD7AQ9UPZ6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms