Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms