Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms