Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms