Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ABCG2Q9UNQ0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms