Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms