Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM82

SPATA2, Spermatogenesis-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA2Q9UM82 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA2Q9UM82 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA2Q9UM82 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms