Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms