Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms