Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP68Q9UHB9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms