Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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