Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms