Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms